在随后的国家安全委员会执行委员会上他表示，不论赫鲁晓夫的真实意图是什么，米国必须做出坚决有力的反应，迫使苏联拆除并撤回自己的导弹。
他接下来要考虑的问题是：如何既不冒同苏联进行一场核冲突的危险，又能清除掉在古巴的导弹。
直到21日早上，肯尼迪还没考虑任何政治或外交解决办法，他关注的点还是军事选择。
他认为有四种军事行动可供选择：对已经发现的三个导弹基地进行空中打击；对机场、导弹基地和其它相关辅助设施发动更大规模的攻击；封锁古巴；实施全面入侵。
随着讨论的深入，肯尼迪的主意越来越坚定，那就是封锁，他把行动定义为“为了有限目的进行有限封锁”。
10月22日晚7点，他向全国发表电视讲话，指出苏联正在古巴建设进攻性导弹基地，这样会对整个美洲和平与安全的造成明显威胁，这是“对现状的故意挑衅性的、毫无理由的改变”，是米国完全不能接受的。
他强调，米国不可动摇的目标是：这些导弹不会被用来攻击米国或其他任何国家，并使这些导弹从美洲撤走或消除。
为此，他提出了对古巴实施海上“隔离”等几项“初步措施。”
在讲话前几小时，全球米军已经进入3级战备状态。
加勒比海和南大西洋区域部署183艘船只，其中包括8艘航母、2艘巡洋舰、118艘驱逐舰、13艘潜艇，还有68个空中中队。
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