但世上没有不透风的墙。
在某个神秘人的提点下，隐藏在雨隐村的长门再次被志村团藏找到，他们创立的晓组织也因此被团藏和山椒鱼半藏联手灭掉，长门继续开始了逃亡的生涯。
.......
故事的结局。
多年后，流落在外的漩涡族人纷纷长大成人。
雨忍村，长大成人的漩涡长门凭借着轮回眼，杀死了山椒鱼半藏，把真个雨隐村收入囊中。
火之国，志村团藏为了当上火影，趁着玖辛奈生产之际，制造了九尾之乱，害死了玖辛奈。
草之国，漩涡一族，战神归来，直接灭了草忍村。
火之国边境的一个村落，一个红头发的小女孩，体内被封印了一只怪兽。
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