这个广大的世界存在着许多名为神奇宝贝的神秘生物，牠们拥有不同的属X、样貌与能力，数量则是一个谜，好似永远都有未知的神奇宝贝都在等着人类发掘。
大部分的人类都与神奇宝贝相处融洽，将神奇宝贝当成是家人、朋友或者夥伴，然而，并不是所有人都是希望与牠们和睦相处的，有些人类以抓特定的神奇宝贝当作工作，这些神奇宝贝通常会被贩卖给有钱的收藏家，甚至还有人组成了邪恶组织，为了实现自己的目的而伤害他人。
『那是不对的！』曾经有一名少nV这麽对着那些组织的人喊道，她那GU想保护大家的炽热在心中蔓延开来，促使了这份冲动……也导致了不好的後果。
那名拥有金sE长发的少nV的传闻在组织中传开了，但是，组织中的头目并未听从她的话语，倒是因此发现少nVT内拥有可以召唤神兽的能量，并下令抓住她，虽然她在千钧一发之际逃掉了，但也成了往後各类组织追杀的永久目标。
这种事情不断持续着，她依然不肯放弃，但还是没有阻止邪恶势力的产生与恶化……一直到现在，在这个叫做「亚克森」的地区，她准备展开新的旅途。
所谓神奇宝贝训练家正是和神奇宝贝共存的人类，收服并训练牠们，最後与牠们一起展开冒险，一起旅行，大部分的训练家都是如此。
当孩子十岁的时候，当地的神奇宝贝研究所就会把新生用神奇宝贝交给他们，并协助他们开始自己的旅行。
「终於到了旅行的日子！哈！」在床上快速的坐起，娇小的少年伸了个大大的懒腰，随後跳下床铺，乖乖换上了妈妈特地为他准备的衣物。
换好之後，他走到立於床边的镜子前头，画面中可以看到一名顶着棕发的少年，他穿着蓝sE的短袖上衣和金属sE的短K，十足的稚气。
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