在后金强大的压力下，漠南蒙古左翼纷纷投向了后金，走投无路的林丹汗，被迫率领数万部众离开辽河故地，西征漠南蒙古右翼。
在林丹汗西征的路上，蒙古右翼诸部都遭受到了攻击；林丹汗痛击土默特部，不但将其老巢归化城占领，还征服了鄂尔多斯部。
但占据了土默特部和鄂尔多斯部属地的林丹汗日子并不好过，明史记载“其畜牧匮乏，加之塞外霜早，颗粒无收兼厉疫盛行”。
虽然察哈尔部实力受损，但这点实力揍明朝还是足够了的。
明王朝崇祯皇帝登基；这位死社稷的皇帝上台后，听说明王朝居然需要花钱卖太平，当时就怒了，不但“尽革其赏”，还把林丹汗派去要钱的使臣给杀了。
察哈尔破边而入，杀死明朝军民数万人，差点夺大同城；这时崇祯才发现，自己真玩不过蒙古人，无奈之下捏着鼻子恢复了“市赏”。
这时，东边的皇太极觉得林丹汗早晚是个祸害，他召集蒙古各部会盟于西拉木伦河畔；蒙古科尔沁、扎鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁（哈喇慎）、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特等部的首领都汇集在他的麾下，集兵10万一起西征林丹汗。
林丹汗得到消息后，无奈南逃；皇太极分兵三路穷追41天，五月下旬进驻归化城，在得知林丹汗已渡黄河而去后，才停住了脚步。
仓皇西逃的过程中，察哈尔部众大量逃散，皇太极收拢的遗部便有数万人之多。
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