《大航海时代》中战斗跟技能体系都很特殊，技能也没有严格的好坏之后，只要你够勤奋，悟性够高，普通技能练到高级一样能非常厉害。
类比的话，游戏中的战斗体系更像格斗类或者武侠游戏，技能的强弱有时候在于人怎么用，就像乔峰不用降龙十八掌，在聚贤庄用最基础的太祖长拳一样战尽天下英雄。
游戏中的基础战斗职业其实只有五中，剑士、格斗者、力士、狙击手、弓箭手，10级转职成功之后，每个玩家还能选择一个副职业，比如航海士、医师、厨师、船工，当然也有特殊的副职业像音乐家、考古家、铁匠、杂技表演者、科学家等等。
职业的组合同样是这款游戏的一大特色，玩家的主职业是战斗职业，副职业一般都是辅助或者生活类职业，组合极其丰富。
玩家选择副职业之后，资质天赋会有一定的修正，并能够学习相关技能。
比如航海士、医师的资质加成是智力，并能够领悟“自然之力”和医疗相关技能，同样能够学习自然属性和医疗相关的战斗技能，厨师、船工的加成分别是力量和耐力，一样能够学习相关技能。
像玩家想学习山治的技能，就要求玩家必须是格斗者和厨师的组合，想像火狐锦卫门一样刀上带火，就需要剑士和航海士的组合。
航海士可以扛斧头，医师也可以拿枪，这些都完全不冲突，前世付云选择的就是一个特殊的副职业——酿酒师。
二刀流剑士+酿酒师，双特殊职业，饮酒后对自身属性有特殊加成，堪称绝佳的暴力搭配。
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