接下来的问题就是，朱元璋曾经出家的龙兴寺，还有凤阳的明朝皇陵该如何处置？
按照吉庆玉的建议，一定是要烧寺、拆殿、刨坟的。关于凤阳的龙脉，早就有各种各样的传说，吉庆玉也都整理出来了，还有本地道士献压胜之法。
自然，王瑾一个都没采纳。
“昔日朱元璋入南京时，揭榜禁剽掠，有卒违令，斩以徇。降兵疑惧不自保，元璋解甲酣寝达旦，众心始安。居民各安堵如故，贤士礼用之，旧政不便者除之，毋使吏贪暴殃民。以康茂才为营田使，劝农桑，发粟振贫民。由是得军心、绅心、民心，虽仍有缺憾，亦足为其时群雄之冠，故可得天下，与鬼神龙脉这等虚无缥缈之说何干。”
“陵中所葬，乃是朱元璋的父母兄嫂，皆与我等一般，是乱世中之苦命人，生前不得享丝毫福泽，死于饥寒病痛，更无半分伤害于人。纵然后世子孙不肖，我等又何必与冢中枯骨为难？”
“当年朱元璋亦一穷汉，于皇觉寺，即今日之龙兴寺中出家，不过想苟全性命于乱世。怎奈元兵杀良冒功，逼其不得不反，这才有了明朝的太祖皇帝。可是朱家人做了皇帝之后，又来欺压我等穷汉，大明朝的官兵又来杀良冒功。”
“我非但不会烧寺毁陵，反倒要在皇陵享殿祭朱元璋，凡是反抗暴政，于百姓有益之人，都是我们的先辈。”
王瑾在皇陵中布设了祭坛，告祭朱元璋，但是这个祭典对于大明朝来说相当尴尬。
王瑾祭奠的不仅仅是朱元璋而已。排在第一位的是韩山童，其次是刘福通，然后是大宋皇帝韩林儿、天完皇帝徐寿辉、大夏皇帝明玉珍，此外还有彭莹玉、周子旺、芝麻李、布王三、孟海马、郭子兴、毛贵、关先生、破头潘等元末义军领袖，接下来才是朱元璋和明朝诸开国功臣。就连被朱元璋清算的蓝玉、李善长等人，也都在祭祀之列。
列入祭祀行列，并不代表王瑾完全认可此人的作为，在不少人的祭文之中也多有批评之辞，但是对于这些人反抗元朝暴政，匡天下重归太平的贡献，还是要感谢的。
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