可是一到民国时代，即大为不同，如在民国廿二年三月海军部编纂的《海军部职员录》中，海军部内共有204人，其中福建人即有142之多，约占全数的70%。
其他海军总司令及各舰队司令，乃至各海军机构的首长，也是非闽人莫属，其垄断可见一斑。
“闽系”一词的来源，实以清光绪十六年（1890）北洋海军总查琅威理所用的“”（福建帮）为最早。
琅氏于北洋海军建军之初，曾经先后二次受聘自英来华，担任北洋舰队的海军总查，成绩斐然。可是却因遭受军中少壮派将领之反对，而于光绪十六年二月（1890年3月）中旬发生香港升旗事件，迫使其愤而辞职。
琅氏在向英海军部报告中，认为“升旗事件”乃系林泰曾（左翼总兵）、刘步蟾（右翼总兵）以及李鸿章的英文秘书罗丰禄和北洋水师学堂总教习严宗光（复）等福建人故意排挤他的一项阴谋，故而使用“福建帮”一词。
在同一报告中，琅氏并曾指出：福建帮在舰队中的势力极大，一旦使之当权，则海军即可能为他们所毁坏。
那时候，“该舰队即将变成福建人家族的舰队，各舰艇即将为他们的亲族所充满，而训练有素的北方人也将要被他们所踢开”。
琅氏之所言可能系出于一时的激愤。但从日后闽系海军的表现来看，却多少亦为他不幸所言中。
福建人单独掌控海军，也几乎决定了其后数十年中国海军的命运。
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