15世纪30年代，当年的喀喇沁军和他们的家属以及喀喇沁牧户逐渐发展演变成为一个强盛的部族，被称为喀喇沁部。
他们仍然游牧在元朝时期的漠北地区原岭北行省和宁路之西的称海宣慰司境内。
这时的喀喇沁部是在阿速特部首领阿鲁台的统领之下。
阿速特部祖先是13世纪生活在高加索附近的阿思、阿兰人，1239年，被西征的蒙古军带回蒙古高原后组成阿速军服务于蒙古大汗，这些人便是后来阿速特部祖先。
他们与喀喇沁人有着基本相同的经历，祖先都来自于西方。
这两部也成为日后右翼蒙古永谢布万户的主要鄂托克。
1449年，也先太师率部南下，对明王朝发动了“土木之役”，明50万大军全军覆没，也先在土木堡俘获了明英宗皇帝。
在这之后，明军被迫放弃了之前所占领的漠南地区，全面退守明长城以南。也先也于1453年登上蒙古大汗之位，成为蒙古历史上唯一非黄金家族出身的大汗。
但是好景不长，在登上汗位的第二年，当时在脱脱不花汗时期任枢密院知院一职的阿剌因对也先不满与之反目，遂起兵杀死了也先汗。
从此卫拉特部势力瓦解，也先余部迅速退出东蒙古地区，也失去了对喀喇沁部的统治权。
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